Activa tu Firewall, ubicate en el panel del control y elije la opcion firewall windows, donde dice Activado (recomendado), elije esa opcion... un modo rapido!!
mira he visto varios tipos conexiones entrantes, el modo del cual poder evitar una conexion remota, es depende que tipo de conexion le permite tu maquina...
ejemplo si tienes un troyano, tendrias que buscar el troyano y eliminarlo.
si tuvieras activado el telnet, tendrias de desactivar esa opcion.
si tienes activado el escritorio remoto, igual tambien tendrias que desactivar la opcion "escritorio remoto"
si tuvieras un agujero de seguridad el cual el visitante te tiene como shell remota, un antivirus actualizado y el parche correspondient
e seria lo mas logico, bueno el tema es extenso.. solo te brindo alguna informacion,
algo de paranoia, existen por ahi "codigos personales" programas que permiten crearte archivos, ya sea mediante ramificacion de del registro, estos personalizan, puede ser un .txt y pueden llamarlo hacker.txt jajaja eso es falso nadie te a tocado, solo que hay programas que navegando puedes haberlo bajado de casualidad y tu crees que alguien ha entrado, pero no es asi, pueden ser .hta,vb,xml,php,js,

saludos